嘉庆五年，阮元在杭州的成功也得到了朝中一致认可，即便是一向对阮元升迁过速不满的庆桂，也不得不暂时偃旗息鼓，承认阮元救灾海防之功。嘉庆也一直对阮元赞许有加，称阮元保举有功将士，从来以赏银为主，厚待士卒，但却绝不轻易保举官职，深得士众之心的同时，也没有乱了朝廷法度。每逢决案，亦必详慎，刑案文卷事由、证据清楚明白，绝无枉法怠惰之处。甚至有几次和纽祜禄氏独处之际，也不觉对她说起了这些。
“既然阮元做得好，那就多让他做几年浙江巡抚吧。”看着阮元确是个实干之臣，嘉庆一时间也对他再无疑虑。
可到了年终，阮元与抚院众人清点账目之时，阮元却依然愁容满面。
“也就是说，整个嘉庆五年，我们实际上一点亏空也补不上吗？”阮元问道。
“是这样的。”孙星衍道：“这一年来，能追赔的官员欠款，倒是追回了不少，可海防要用钱、赈灾要用钱，寻常开支，又不见少，能保证不出现新的亏空，已是很不容易了。”
“我也问过皇上，皇上的意思是，支援川楚的军费不算在开支之内，受灾各府县赋税，也都已经蠲免了，即便如此，想要补上这个漏洞，还是这般困难啊？”阮元叹道。
“多亏了前线将士用命，今年后半年屡战屡捷啊。”孙星衍道：“听前线战报，说那最初传播白莲教的刘之协，前些日子已经落网了。此外今年冉天元、刘允恭、杨开甲各部均被剿灭，还有不少人投降了朝廷。川楚形势，已然见好，敌人余部盘踞山岭，也有一段时间不敢和官军正面交战了。这样看来，若是来年战事有所缓和，说不定咱们浙江，就不用调那么多银子去前线了。”他所言刘之协是最初在湖北传播白莲教的反清领袖，在民众中颇有号召力，这一年他被清将马慧裕俘杀，对于白莲教众而言，是个不小的打击。而当战事进入嘉庆五年之末，白莲教众也渐渐无力支撑，只能分散川楚险要之处，继续做困兽之斗。
“这倒是个好消息，可对于咱们赔补亏空，帮助还是有限啊。”阮元沉思道：“今年海防之事甚多，原本想着清查仓库，都没能办成，到了来年，也只能希望海上战事少些，能多出些时间，来继续整顿政事了。兰泉先生，这亏空之事，还有何处可以一并着手呢？”
“仓库、海塘、盐务、北新关的关税，都是多弊之处，还有这馈赠之事，从来消耗公帑，也不在少数。伯元，你虽已告知浙江大小官吏，凡上门送礼，一概不收，可藩司臬司、各道府县，要想一并禁绝馈赠之弊，可不容易啊？”王昶道。
“伯元，我倒是不清楚，皇上那边，对这赔补亏空，究竟有没有年限呢？若是时间紧迫，那不如先将今年的岁入挪去补往年的亏空，至于今年的账，虽然也会出现新亏，可总能为皇上解一时之困，或许皇上见你补缺有功，还能让你多做几年巡抚呢，这样的话，以后还有的是时间，来补现在的亏空，你说这样如何？”孙星衍和阮元一样为官多年，清楚官场上勒令补缺，往往有操之过急之弊，是以这时也不得不为长久之计，向阮元建议道。
“是啊，伯元，听闻其他各省补亏空，也有这样做的。”焦循补充道。
可阮元想了想，却摇了摇头。
“渊如兄，此举万万不可。”阮元道：“今年的账，就先用到今年该做的事上，若有盈余，再补亏空，切不可有以新账补旧账之念。若如此，则浙江亏空，只是表面得到赔补，其实亏损仍在。而且，若是下属官员眼看旧账得补，或许便会产生懈怠之念，以为国库公帑，虽滥支而无虞，因为总有明年的账要补今年嘛？可这样一来，以后会怎么样？亏空不仅补不上，多半还会越来越多。这样下来，岂不是苦了以后的浙江巡抚吗？”
“伯元，我本意也不想……”孙星衍也连忙解释。
“渊如兄，我清楚你心意，你也是担心我这样赔补亏空，只怕再过一年半载，收效也不明显，到时候皇上可能便会责难于我，甚至免了我巡抚之职。但你有所不知，我临行之前，便与皇上商议过赔补亏空之事，皇上的意思，也是不急于一时，切不可因为朝廷欠了旧账，就让今日的百姓多受赋役之苦。再说了，今年我们海防上总也是有功的，说不定皇上看我们在这里能制住那些海盗，就会多给我些时日呢？所以这赔补亏空之时，我不仅不会以新账补旧账，还要把新账旧账分别计算，要永远清楚，我们还有多少事要做。”阮元说着说着，似乎也有了新的办法。
“伯元，你的意思是……”王昶也看出了阮元的心思。
“兰泉先生，您看我这个办法如何？”阮元问道：“从明年开始，我们把账分成两部分，一部分是今年和以前的旧账，另一部分是从明年开始的新账。若是新账有了盈余，再拿盈余来补过旧账，若是新账尚有亏空，后面的收入就先补新账。如此账目清楚，官吏就算想要暗中增加赋税，也极易被察觉。而如果旧账仍有亏空，官吏也必然心生戒惧，不敢滥支新账。这样百姓无增赋之困窘，官员无滥支之怠惰，赔补亏空之事，以后便可以有序进行了。我这个办法，可否推行下去呢？”
“嗯……若是伯元真的不在意赔补年限的话，这个办法或许可行。”王昶沉思了一会儿，回答道：“可是伯元，若是浙江亏空，按你这个计划赔补，我看即便能清楚一些弊政，少一些滥支滥用，也要七八年以上，才能补足啊？却不知皇上那边，可有这个耐心吗？”
“兰泉先生，我相信皇上是愿意等下去的，如果一两年内，我们能再清理一些积弊，至少补上一些旧账，皇上那边，就会有信心了。至于其他，就先由我这个巡抚扛着吧。”阮元点头道。
“好，既然如此，老夫也愿意在尽一份力，帮着你这里，先将这新旧两份账，都一一清理出来！”王昶笑道。
海防之患，经过阮元一年的办理，总算渐渐有了起色。可接下来的赔补亏空，却依然让阮元不敢放松。