就在这时，李长庚等人也开展了进一步清剿海盗的计划。九月之初，李长庚遣岳玺、胡振声两镇战船，前后夹击林亚孙，这时已将林亚孙四面包围。
“砰！砰！”隆隆的炮声中，官军的包围圈开始逐渐收缩。
原来，虽然林亚孙在逃出松门之时，尚有十余艘大船，这时还准备勉力一战。可经过一场数十年不遇的暴风雨，林亚孙手下帮众，大半已是心惊胆裂，这时水澳帮中，也渐渐出现了传言，说阮元和李长庚有神灵相助，即便是观音妈祖，也都站在了阮李二人一旁，如若不然，他们又怎会遇上这等狂风暴雨？是以海盗与官军方一接战，不少海盗便有如见到天兵天将一般，只发一声喊，便即四散而逃。岳玺和胡振声也不在意逃出船只，只直奔林亚孙主舰而来，不过一个时辰，林亚孙主舰之旁，便只剩下两艘大船尚在抵抗，随着官船炮声想起，这两艘船也相继中弹起火。
“帮主，要不……要不咱们投降了吧？这官府定是得了观音菩萨、妈祖娘娘之力，咱们打不过他们啊？听说之前松门的降人，都过得不错呢，帮主您就帮帮咱们弟兄吧？”一名指挥开炮的水澳帮头目眼看大势已去，索性弃了炮位，奔到林亚孙面前乞求投降。
“投降，你去找阎王爷投降吧！”林亚孙大怒，手起一刀，便将那头目戳翻在地，接着对炮手吼道：“开炮！开炮！跟他们拼了！”
“砰！砰！”
无奈天不随人愿，岳玺、胡振声的炮比林亚孙主舰要多，在更加猛烈的炮击之下，林亚孙主舰也连声中弹。炮手们大惊失色，纷纷弃了炮位，四散奔逃，有些索性直接跳入海中，向官船游了过去。
“林亚孙，速速投降，本官饶你不死！”这时，胡振声的坐舰已经贴了上来，距离林亚孙主舰不过十余丈，官军船舰上的声音，海盗们已经可以听得一清二楚。
“放屁！”林亚孙声嘶力竭的吼着。
忽然之间，十天之前的一幕再次涌现在他眼前。
那一日，蔡牵不知如何，竟发现了自己的踪迹，主动找到了自己。他起初还想着蔡牵或许回心转意，想要重新加入水澳帮，想着水澳帮已然衰落，若是蔡牵有如此请求，便答应了也好。可不想蔡牵刚一和他会面，便即提出，希望林亚孙抛弃水澳帮之名，加入蔡牵旗下。
林亚孙当即大怒，把蔡牵一顿痛骂，让他赶紧滚蛋。谁知蔡牵听了，也不发怒，只冷冷对林亚孙道：“林帮主，若你还想在这片海上过日子，今天，就是你最后的机会了。”
那时他无论如何都想象不到，不过十天，蔡牵之言竟一语成谶。
看着自己眼前已经被围得密不透风的海面，林亚孙终于清楚，这一天，他除了投降官府，再无生路。
然而他还是放弃了投降。
“狗官！想要领功，就带着老子的尸首回去吧！老子就算死，也是这水澳帮的堂堂帮主！”
说罢，林亚孙回过刀来，在自己颈上奋力一划，血流登时喷射而出。
水澳帮的名字，就此消失在浙江海面。
就在这时，蔡牵又找到了福建海面上的庄有美。
“庄帮主，实不相瞒，官府盯上林亚孙了，他不愿做我的下属，多半也不会投降官府，只怕他性命也就在这一两日之间了。从现在起，这闽浙海上便只有我和庄帮主两队船了，若是庄帮主愿意和我同舟共济，这海上的金银财宝，你以后还有份。”蔡牵似乎还在打庄有美的主意。
“蔡牵，你还想让我做你的手下吗？”庄有美道。可说着说着，庄有美似乎失去了底气，突然长叹了一声，自嘲着笑道：“可你还打得动仗吗？松门回来以后，我手下船只损毁大半，我早就清楚，海上的日子，我过不下去了，再这样和官府为敌，我只有死路一条。所以实不相瞒，我前些日子，便联系了这闽浙的总督玉德，他愿意接受我们投降，安稳过完后半辈子，就不错了。”
“庄帮主，你何必如此灰心呢？”蔡牵劝道：“若是咱们以后互通声气，有福同享，在这闽浙海上，一样有希望重整旗鼓啊？”
“蔡牵，我意已决，今日能和你见这一面，我已经给你留面子了。”庄有美道：“我凤尾帮和你水澳帮一向不和，本来我可以趁这个机会抓了你去福州请赏。但我想想，还是算了吧，咱们好歹都在伦贵利手下卖过命，都是一条船上的蚂蚱，何苦相互为难呢？你以后自做你的蔡帮主，我也图个名声，就不为难你了，你带着你这些船走吧。若是再遇到你，我可就没法客气了。”
蔡牵眼看庄有美去意已决，也不再强迫于他，只好带了自己所部南下。几日之后，庄有美将自己所率船只开到福州，便即向玉德投降。玉德看着一下子来了这许多降众，自然大喜过望，忙将庄有美所部一并安排进了绿营，自己则添油加醋的向嘉庆邀功请赏去了。凤尾帮的名字，也就此烟消云散。
就这样，嘉庆四年冬天尚是浙江海防大患的四大海盗势力，在不过一年的时间里，全部覆灭。
这边阮元眼看赈灾之事渐已有序，大半灾区放赈也开始进入尾声，便离了金华，回归杭州而来。一路之上，阮元也相继接到了水澳帮覆灭，凤尾帮投降的消息，想着这一年以来，自己在浙江查保甲、造船炮、击海寇、赈灾民，着实办了不少有利国泰民安的要事，心中也不禁略感快慰，看来一年的辛苦，终究没有白费。
不觉之间，嘉庆五年也已经到了最后一个月，可阮元的公务却依然繁多。这日回到自己内室，阮元仍在悉心清点着一份份奏报，似乎这些奏报不能有一丝疏漏。
“夫子，今日还有这许多事要办吗？”孔璐华这时已经梳洗完毕，可看着阮元依然不愿就寝，心中不免寂寥，便走近到了阮元身旁，看着他案上的文卷，叹道：“夫子这一年下来，可是好辛苦啊。你说，这入夜之后能安心就寝的日子，一年到头，都没有几个呢。”
“是啊，这段日子，海防、刑狱之事，还有不少要上奏皇上呢。”阮元道：“这些都是今年海战之中立功将士的奏报，事关他们升赏，不能不谨慎啊。还有那些刑案，若是出了疏漏，那也事关一人一家的未来啊？不过今日我看这些，也只是重新清查一遍，很快就忙完了，夫人还是先去就寝吧。”
“夫子，你若是这般辛苦，平日也该善待自己才是啊？”孔璐华不无担忧的说道：“你说前几个月，百姓受赈，你一个浙江巡抚，居然和百姓一样，每日只两餐清粥，食粥之量，还不能超过百姓受赈之数。夫子，你这样日夜辛劳，身子可怎么受得了啊？”
“可是夫人，看那些百姓每日辛勤劳作，却也只得那两餐清粥度日，我又怎么好意思安居饱食呢？再说了，我平日既有朝廷官俸，又有抚院护卫，本来生活就已经比他们安稳多了，若是饮食之事，都不能和他们同舟共济，将来百姓想起我这个父母官，还不得心生怨念啊？”阮元笑道。
“可是夫子和他们不一样！”孔璐华说着说着，也不免有些真情流露：“夫子，你这一年做了什么，别人不清楚，难道夫人还不清楚吗？在杭州，你力行捕盗，亲查赈粮，护一方百姓平安，在浙东，你重振水师声威，大败各路海寇，你这一年的功劳，比寻常巡抚五年七年的都要多！可也正因为如此，这浙江一省，这巡抚部院，也都离不开你啊？夫子你想想，若是你真的病倒了，咱们阮家怎么办，这浙江该怎么办？就算夫子别的都不顾了，若是这浙江换了一个巡抚，这赈灾海防之事，他还能像夫子一般尽心尽力吗？就算他也一样勤于任事，这用兵治吏之才，他能比得上夫子吗？所以夫子这样想想，也该好好爱惜自己身子才对啊？”阮元看向妻子时，只觉她双目莹莹，是真心为自己担忧，可面色之下，却也隐隐有些得意，看来自己无论学识才干，都进一步得到了孔璐华的认可。
“哈哈，夫人这般说来，我都不知道夫人是在担心我，还是在夸我了。也好，这些文卷我本来也都看完了，也是我做这巡抚时日不长，还是太谨慎了。今日就早些歇息，夫人也先回去，早点就寝吧？”阮元笑道。
“夫子，你怎么这就说上就寝的事了？”谁知孔璐华听了之后，似乎不仅不满意阮元这个回答，还意外的多了一份幽怨。说着，孔璐华也探出双臂，轻轻笼在了阮元右臂之上，轻声道：“夫子，你怎么也不想想，我们都已经好久……”说着说着，粉颊之上也带上了一阵晕红。
“夫人，这……”阮元也不禁哑然失笑，道：“夫人，今日也都入夜了，夫人也早些休息吧，明天还……”
“夫子，嘻嘻……”忽然之间，孔璐华双眸一闪，对阮元轻轻笑道：“夫人最近看到一片文章，里面有几句话，夫人看不懂呢，要不，夫子先帮我解释一下如何？”
“好啊，夫人是遇到什么难解之语了？”
“嗯……这几句话是……欲生于情，在性之内，不能言性内无欲，欲不是善恶之恶。天既生人以血气心知，则不能无欲，若天下人皆如佛绝欲，则举世无生人。欲在有节，不可纵，不可穷。夫子，这段话，夫子要不要从头开始，给夫人讲讲是什么意思啊？”孔璐华说着说着，得意之情，已是溢于言表。
阮元听着，也不禁暗暗惊叹，因为这正是他的一篇解经之作。
“夫人，这……我这篇《性命古训》，只不过是一时闲暇，偶一为之，其中尚有不少缺漏之处，还没准备正式定稿呢，夫人你不能……”阮元还在想着解释一番。
“夫子这篇文章叫《性命古训》呀？可是夫人看着，你写得很好啊？这篇文章上能引圣人之言，下能贯穿古今之事，可是一篇佳作呢。还是说，夫子你平日所言考据之言，只是为了欺瞒夫人呢？”孔璐华开始进一步展开攻势。
“夫人，话虽如此，可今日毕竟入夜了，要不还是来日……”
“夫子，你说的‘来日’，是哪一日啊？”孔璐华道：“今年一年，我都还记着呢，一共才……才只有七日，夫子，这节欲不同于绝欲，可是夫子自己说的呢。怎么，这句话到了夫子自己身上，就不作数了吗？”
这样说来，阮元也有些歉疚，看着孔璐华时，只见她面色之间，隐有憔悴之态，想来一年里自己有大半年不在杭州，抚院事务大多是妻子一力操劳，也着实难为了她。又见她温柔俏丽，依然不减从前，与自己同舟共济五载，更是多了一份成熟风韵，不由得暗暗心动，笑道：“这般看来，夫人是真心喜欢这样的日子啊？”
“那当然了。”孔璐华轻轻一笑，柔声道：“和夫子在一起做夫妻，我……我很开心啊？夫子人又温柔，又有学问，这一年下来，你也成了浙江的英雄了，能和夫子在一起，这样的日子，多少人想羡慕，还羡慕不来呢。”
阮元看着妻子情意深重，心中更是激荡，不觉之间，竟也将孔璐华抱了起来。
“夫子，你……你抱着我做什么啊？”孔璐华也不觉吃了一惊。
“和夫人在一起，也是我的福分啊？”阮元笑道：“夫人可是堂堂衍生公府的千金小姐，海内第一美人呢。而且，夫人诗作，在国朝女子之中，也算首屈一指了，能与夫人这般才貌双全的佳人做夫妻，我也很开心啊？”
“夫子，你什么时候这般油嘴滑舌了？你放我下来！”
“怎么？方才不是夫人主动开的口吗？夫人还想反悔不成？”
……
不过这个夜晚，孔璐华还是非常满意，因为直到夜深人静之时，阮元依然握着她的手臂，不愿放开。
“夫子，你怎么还握着我的手啊？夫人的手好看吗？”
“是啊，夫人的手就像玉雕一样，特别美。”
“唉，夫子这出门大半年，也不知和谁学了这番话来，都有些不像夫子了。不过……嘻嘻……”孔璐华言语上虽不相让，心中却是无比开心，可这一夜欣喜之余，她却也意外的想起了与她同迎风雨的刘文如。
“夫子，有件事，我想和你商量一下……”
“夫人这又是怎么了？有什么事是夫人想说，却又不好意思开口的呢？哈哈，这可是难到我了。”阮元不禁笑道。
“夫子，以后要是有闲暇的时间，你……你也去陪陪书之姐姐和月庄吧。她们总也是你的妾，若是进了咱们阮家这许多年，还都没有一儿半女，也是我对不起她们……”孔璐华终于把这段话说了出来。
“哈哈，夫人这话，却也不像以前的夫人了啊？”阮元笑道：“怎么？是爹爹想要孙子了，才这样和你说的，还是……”
“爹爹没说什么……”孔璐华玉颊上又是一阵晕红，小声道：“夫子，其实这些日子，我也想清楚了，我想要夫子这个丈夫，可我也舍不得她们这两个姐妹啊？这几年下来，都是我和你同房，她们那里，你一次都没去过，这样她们心里，其实也不好受啊？回头想想，也是夫子为了照顾我，才这样的，可这样下来，我总是觉得，和书之、月庄她们，就不算真正的姐妹了。所以我也想着，要不就把你分给她们几日，这样我们就两全其美了，多好啊？而且，或许书之姐姐比我幸运，过得几日，就真的有了孩子，也说不定呢。”
“既然夫人都开口了，那……这样也好吧。不过，夫人的心思可真有趣啊？”阮元笑道。
“你笑什么？我可警告你，虽然我允许你去她们那边了，但你不许连续在那边过夜！夫人这里，你要是有半分懈怠，我一样要你好看！”
“好，我都听夫人的还不够吗？”
“再诚恳一点！”
……
不久之后，刘文如和谢雪也终于得到了和阮元同房的机会。